Spoločnosť UNIPHARMA založil v roku 1992 lekárnik RNDr. Tomislav Jurik, CSc., s cieľom vybudovať obchodnú spoločnosť na distribúciu liekov s účasťou lekárnikov – majiteľov lekární na Slovensku. Novú distribučnú spoločnosť začal budovať v prenajatých priestoroch v obci Koš pri Prievidzi. Malá spoločnosť UNIPHARMA, spol. s r.o. dokázala hneď od začiatku realizovať objednávky do lekární na dennej báze, narozdiel od vtedajšej konkurencie. Kvalita sortimentu a služieb, flexibilita a rýchlosť distribúcie liekov boli od začiatku najväčšou devízou firmy.
Po ukončení pôsobenia v obci Koš (1992 – 1995) sa UNIPHARMA presťahovala do Prievidze (1994 – 1999) a v roku 1999 do vlastného administratívneho a skladového centra UNIPHARMY v Bojniciach. Od roku 1995 zabezpečovala distribúciu aj v Bratislave a v Prešove, avšak zatiaľ len v prenajatých priestoroch. Následne, v roku 2002, zriadila UNIPHARMA vo vlastných priestoroch bratislavskú pobočku a o dva roky neskôr, v roku 2004, bola otvorená pobočka v Prešove.
Základným cieľom vzniku obchodnej spoločnosti bolo zapojiť do spolupráce lekárnikov. Kľúčovým rokom sa stal rok 1995, kedy spoločnosť nadobudla celoštátne pôsobenie a lekárnici tak mohli byť zapojení do riadenia lekárnickej distribúcie. Ako najlepšia cesta sa ukázala transformácia firmy na akciovú spoločnosť a následná ponuka akcií spoločnosti lekárnikom – svojim zákazníkom. Týmto spôsobom lekárnici získali majoritný podiel v spoločnosti, ktorá sa postupne stala ich spoľahlivým partnerom a taktiež ochrancom slobodného výkonu lekárnického povolania na Slovensku.
Okrem veľkodistribučných aktivít poskytovala UNIPHARMA od roku 2002 aj zdravotnú starostlivosť vo svojich vlastných zdravotníckych zariadeniach, v rokoch 2002 až 2014 v nemocniciach Košice – Šaca (od roku 2002), Handlová (od roku 2004) a Bánovce nad Bebravou (od roku 2006). Počas tejto doby získala Nemocnica Košice – Šaca ocenenie Slovak Gold Exclusive, ktoré jej bol udelené za výborné hospodárske výsledky a stabilitu. Od roku 2008 UNIPHARMA prevádzkovala špičkové medicínske centrum uniKLINIKA kardinála Korca v Prievidzi, od roku 2016 pribudlo do portfólia zdravotníckych zariadení diagnostické medicínske centrum uniCENTRUM v Bojniciach a od roku 2017 uniPOLIKLINIKA Dubnica nad Váhom
Zlomovým dátumom v histórii spoločnosti UNIPHARMA – 1.slovenská lekárnická akciová spoločnosť je 4.apríl 2020. V tento deň došlo po viac ako 25 rokoch k zmene v riadiacich a kontrolných orgánoch. Predsedom predstavenstva sa stal Mgr. Milan Vrúbel, ktorý bol následne predstavenstvom spoločnosti menovaný do funkcie generálneho riaditeľa.